bbmap 이란?
bbmap은 Ilumnia 또는 Pacbio와 같은 시퀀싱 장비에서 생산된 어셈블인 RNA와 DNA 정렬을 위한 툴입니다.
bbmap 세팅 메뉴얼
Ubuntu 기준으로 설치 되는 메뉴얼입니다.
1. http://sourceforge.net/projects/bbmap/files/latest/download 에서 bbmap을 다운받습니다.(ex. BBMap_38.34.tar.gz)
2.원하는 폴더에 BBMap_38.34.tar.gz를 옮긴 후에 압축을 풀어주세요. (Usage. tar zxf BBMap_38.34.tar.gz )
---------------------이곳 까지 완료했으면 local 에서 BBmap or BBduk 을 쓸 수 있습니다.--------------------------
3. PATH 설정
export PATH=$PATH:$HOME/bbmap
'Bioinformatics' 카테고리의 다른 글
PCoA- taxonomic level in Qiime2 (0) | 2020.02.25 |
---|---|
Convert Tsv to Biom File Format (0) | 2019.10.11 |
NCBI blast+ local install OS Linux (0) | 2018.12.13 |
bedtools coverage (0) | 2018.12.04 |
Miso Analysis (0) | 2018.10.29 |